HSG işlemi orta düzeyde bir ağrıya neden olabilir. Ancak bu ağrı kısa süreli ve dayanılmaz değildir. Ağrının şiddeti kişiden kişiye farklılık gösterebilir. Özellikle ilacın uygulanması sırasında rahim bu yabancı maddeye karşı tepki gösterir ve kasılır. Bu ağrı nedeniyle bazen tüpler kasılabilir ve normalde açık olan tüpler kapalı gibi görünebilir.
